| 所屬機關 | 機關所在地點及轄區範圍 |
|---|---|
| 第一河川局 |
宜蘭市 河川:蘭陽及和平溪 海岸:宜蘭縣、部分新北市、馬祖 |
第二河川局 |
新竹市 河川：鳳山、頭前、中港及後龍溪 海岸：桃園市、新竹縣市、部分苗栗縣 |
第三河川局 |
臺中市 河川：大安、大甲及烏溪 海岸：部分苗栗縣、臺中市 |
第四河川局 |
彰化縣 河川：濁水溪 海岸：彰化縣 |
第五河川局 |
嘉義市 河川：北港、朴子、八掌及急水溪 海岸：雲林縣、嘉義縣、部分臺南市 |
第六河川局 |
高雄市 河川：曾文、鹽水、二仁及阿公店溪 海岸：部分臺南市、高雄市 |
第七河川局 |
屏東市 河川：高屏、東港及四重溪 海岸：屏東縣、澎湖縣 |
第八河川局 |
臺東市 河川：卑南溪 海岸：臺東縣、金門縣、連江縣 |
第九河川局 |
花蓮縣 河川：秀姑巒、花蓮溪 海岸：花蓮縣 |
第十河川局 |
新北市 河川：淡水河系、磺溪 海岸：部分新北市、基隆市 |
北區水資源局 |
宜蘭市 轄區：新竹縣以北至宜蘭縣、東部花蓮縣 轄區重要水庫、壩堰：石門、新山、寶山、寶山第二及大埔水庫、隆恩堰 |
中區水資源局 |
臺中市 轄區：苗栗縣以南至雲林縣以北 轄區重要水庫、壩堰：永和山、明德、谷關、德基、鯉魚潭、霧社、日月潭、明湖及明潭水庫、石岡壩、集集攔河堰 |
南區水資源局 |
臺南市、高雄市(曾文辦公區、燕巢辦公區) 轄區：嘉義縣以南至屏東縣、東部臺東縣及澎湖縣 轄區重要水庫、壩堰：仁義潭、蘭潭、白河、尖山埤、南化、烏山頭、曾文、牡丹、阿公店及鳳山水庫、高屏溪攔河堰、甲仙堰 |
臺北水源特定區管理局 |
新北市 轄區：新店溪青潭水源、水質、水量保護區 轄區重要水庫、壩堰：翡翠水庫 |
水利規劃試驗所 |
臺中市 轄區：水利工程計畫之調查、規劃、試驗、研究及分析 |